Spark 系列(三)—— 弹性式数据集RDDs – Python量化投资

Spark 系列(三)—— 弹性式数据集RDDs

一、RDD简介

RDD 全称为 Resilient Distributed Datasets,是 Spark 最基本的数据抽象,它是只读的、分区记录的集合,支持并行操作,可以由外部数据集或其他 RDD 转换而来,它具有以下特性:

  • 一个 RDD 由一个或者多个分区(Partitions)组成。对于 RDD 来说,每个分区会被一个计算任务所处理,用户可以在创建 RDD 时指定其分区个数,如果没有指定,则默认采用程序所分配到的 CPU 的核心数;
  • RDD 拥有一个用于计算分区的函数 compute;
  • RDD 会保存彼此间的依赖关系,RDD 的每次转换都会生成一个新的依赖关系,这种 RDD 之间的依赖关系就像流水线一样。在部分分区数据丢失后,可以通过这种依赖关系重新计算丢失的分区数据,而不是对 RDD 的所有分区进行重新计算;
  • Key-Value 型的 RDD 还拥有 Partitioner(分区器),用于决定数据被存储在哪个分区中,目前 Spark 中支持 HashPartitioner(按照哈希分区) 和 RangeParationer(按照范围进行分区);
  • 一个优先位置列表 (可选),用于存储每个分区的优先位置 (prefered location)。对于一个 HDFS 文件来说,这个列表保存的就是每个分区所在的块的位置,按照“移动数据不如移动计算“的理念,Spark 在进行任务调度的时候,会尽可能的将计算任务分配到其所要处理数据块的存储位置。

RDD[T] 抽象类的部分相关代码如下:

// 由子类实现以计算给定分区
def compute(split: Partition, context: TaskContext): Iterator[T]
// 获取所有分区
protected def getPartitions: Array[Partition]
// 获取所有依赖关系
protected def getDependencies: Seq[Dependency[_]] = deps
// 获取优先位置列表
protected def getPreferredLocations(split: Partition): Seq[String] = Nil
// 分区器 由子类重写以指定它们的分区方式
@transient val partitioner: Option[Partitioner] = None

二、创建RDD

RDD 有两种创建方式,分别介绍如下:

2.1 由现有集合创建

这里使用 spark-shell 进行测试,启动命令如下:

spark-shell --master local[4]

启动 spark-shell 后,程序会自动创建应用上下文,相当于执行了下面的 Scala 语句:

val conf = new SparkConf().setAppName("Spark shell").setMaster("local[4]")
val sc = new SparkContext(conf)

由现有集合创建 RDD,你可以在创建时指定其分区个数,如果没有指定,则采用程序所分配到的 CPU 的核心数:

val data = Array(1, 2, 3, 4, 5)
// 由现有集合创建 RDD,默认分区数为程序所分配到的 CPU 的核心数
val dataRDD = sc.parallelize(data) 
// 查看分区数
dataRDD.getNumPartitions
// 明确指定分区数
val dataRDD = sc.parallelize(data,2)

执行结果如下:

2.2 引用外部存储系统中的数据集

引用外部存储系统中的数据集,例如本地文件系统,HDFS,HBase 或支持 Hadoop InputFormat 的任何数据源。

val fileRDD = sc.textFile("/usr/file/emp.txt")
// 获取第一行文本
fileRDD.take(1)

使用外部存储系统时需要注意以下两点:

  • 如果在集群环境下从本地文件系统读取数据,则要求该文件必须在集群中所有机器上都存在,且路径相同;
  • 支持目录路径,支持压缩文件,支持使用通配符。

2.3 textFile & wholeTextFiles

两者都可以用来读取外部文件,但是返回格式是不同的:

  • textFile:其返回格式是 RDD[String] ,返回的是就是文件内容,RDD 中每一个元素对应一行数据;
  • wholeTextFiles:其返回格式是 RDD[(String, String)],元组中第一个参数是文件路径,第二个参数是文件内容;
  • 两者都提供第二个参数来控制最小分区数;
  • 从 HDFS 上读取文件时,Spark 会为每个块创建一个分区。
def textFile(path: String,minPartitions: Int = defaultMinPartitions): RDD[String] = withScope {...}
def wholeTextFiles(path: String,minPartitions: Int = defaultMinPartitions): RDD[(String, String)]={..}

三、操作RDD

RDD 支持两种类型的操作:transformations(转换,从现有数据集创建新数据集)和 actions(在数据集上运行计算后将值返回到驱动程序)。RDD 中的所有转换操作都是惰性的,它们只是记住这些转换操作,但不会立即执行,只有遇到 action 操作后才会真正的进行计算,这类似于函数式编程中的惰性求值。

val list = List(1, 2, 3)
// map 是一个 transformations 操作,而 foreach 是一个 actions 操作
sc.parallelize(list).map(_ * 10).foreach(println)
// 输出: 10 20 30

四、缓存RDD

4.1 缓存级别

Spark 速度非常快的一个原因是 RDD 支持缓存。成功缓存后,如果之后的操作使用到了该数据集,则直接从缓存中获取。虽然缓存也有丢失的风险,但是由于 RDD 之间的依赖关系,如果某个分区的缓存数据丢失,只需要重新计算该分区即可。

Spark 支持多种缓存级别 :

Storage Level
(存储级别)
Meaning(含义)
MEMORY_ONLY默认的缓存级别,将 RDD 以反序列化的 Java 对象的形式存储在 JVM 中。如果内存空间不够,则部分分区数据将不再缓存。
MEMORY_AND_DISK将 RDD 以反序列化的 Java 对象的形式存储 JVM 中。如果内存空间不够,将未缓存的分区数据存储到磁盘,在需要使用这些分区时从磁盘读取。
MEMORY_ONLY_SER将 RDD 以序列化的 Java 对象的形式进行存储(每个分区为一个 byte 数组)。这种方式比反序列化对象节省存储空间,但在读取时会增加 CPU 的计算负担。仅支持 Java 和 Scala 。
MEMORY_AND_DISK_SER类似于 MEMORY_ONLY_SER,但是溢出的分区数据会存储到磁盘,而不是在用到它们时重新计算。仅支持 Java 和 Scala。
DISK_ONLY只在磁盘上缓存 RDD
MEMORY_ONLY_2,
MEMORY_AND_DISK_2, etc
与上面的对应级别功能相同,但是会为每个分区在集群中的两个节点上建立副本。
OFF_HEAPMEMORY_ONLY_SER 类似,但将数据存储在堆外内存中。这需要启用堆外内存。

启动堆外内存需要配置两个参数:

  • spark.memory.offHeap.enabled :是否开启堆外内存,默认值为 false,需要设置为 true;
  • spark.memory.offHeap.size : 堆外内存空间的大小,默认值为 0,需要设置为正值。

4.2 使用缓存

缓存数据的方法有两个:persistcachecache 内部调用的也是 persist,它是 persist 的特殊化形式,等价于 persist(StorageLevel.MEMORY_ONLY)。示例如下:

// 所有存储级别均定义在 StorageLevel 对象中
fileRDD.persist(StorageLevel.MEMORY_AND_DISK)
fileRDD.cache()

4.3 移除缓存

Spark 会自动监视每个节点上的缓存使用情况,并按照最近最少使用(LRU)的规则删除旧数据分区。当然,你也可以使用 RDD.unpersist() 方法进行手动删除。

五、理解shuffle

5.1 shuffle介绍

在 Spark 中,一个任务对应一个分区,通常不会跨分区操作数据。但如果遇到 reduceByKey 等操作,Spark 必须从所有分区读取数据,并查找所有键的所有值,然后汇总在一起以计算每个键的最终结果 ,这称为 Shuffle

5.2 Shuffle的影响

Shuffle 是一项昂贵的操作,因为它通常会跨节点操作数据,这会涉及磁盘 I/O,网络 I/O,和数据序列化。某些 Shuffle 操作还会消耗大量的堆内存,因为它们使用堆内存来临时存储需要网络传输的数据。Shuffle 还会在磁盘上生成大量中间文件,从 Spark 1.3 开始,这些文件将被保留,直到相应的 RDD 不再使用并进行垃圾回收,这样做是为了避免在计算时重复创建 Shuffle 文件。如果应用程序长期保留对这些 RDD 的引用,则垃圾回收可能在很长一段时间后才会发生,这意味着长时间运行的 Spark 作业可能会占用大量磁盘空间,通常可以使用 spark.local.dir 参数来指定这些临时文件的存储目录。

5.3 导致Shuffle的操作

由于 Shuffle 操作对性能的影响比较大,所以需要特别注意使用,以下操作都会导致 Shuffle:

  • 涉及到重新分区操作: 如 repartitioncoalesce
  • 所有涉及到 ByKey 的操作:如 groupByKeyreduceByKey,但 countByKey 除外;
  • 联结操作:如 cogroupjoin

五、宽依赖和窄依赖

RDD 和它的父 RDD(s) 之间的依赖关系分为两种不同的类型:

  • 窄依赖 (narrow dependency):父 RDDs 的一个分区最多被子 RDDs 一个分区所依赖;
  • 宽依赖 (wide dependency):父 RDDs 的一个分区可以被子 RDDs 的多个子分区所依赖。

如下图,每一个方框表示一个 RDD,带有颜色的矩形表示分区:

区分这两种依赖是非常有用的:

  • 首先,窄依赖允许在一个集群节点上以流水线的方式(pipeline)对父分区数据进行计算,例如先执行 map 操作,然后执行 filter 操作。而宽依赖则需要计算好所有父分区的数据,然后再在节点之间进行 Shuffle,这与 MapReduce 类似。
  • 窄依赖能够更有效地进行数据恢复,因为只需重新对丢失分区的父分区进行计算,且不同节点之间可以并行计算;而对于宽依赖而言,如果数据丢失,则需要对所有父分区数据进行计算并再次 Shuffle。

六、DAG的生成

RDD(s) 及其之间的依赖关系组成了 DAG(有向无环图),DAG 定义了这些 RDD(s) 之间的 Lineage(血统) 关系,通过血统关系,如果一个 RDD 的部分或者全部计算结果丢失了,也可以重新进行计算。那么 Spark 是如何根据 DAG 来生成计算任务呢?主要是根据依赖关系的不同将 DAG 划分为不同的计算阶段 (Stage):

  • 对于窄依赖,由于分区的依赖关系是确定的,其转换操作可以在同一个线程执行,所以可以划分到同一个执行阶段;
  • 对于宽依赖,由于 Shuffle 的存在,只能在父 RDD(s) 被 Shuffle 处理完成后,才能开始接下来的计算,因此遇到宽依赖就需要重新划分阶段。

参考资料

  1. 张安站 . Spark 技术内幕:深入解析 Spark 内核架构设计与实现原理[M] . 机械工业出版社 . 2015-09-01
  2. RDD Programming Guide
  3. RDD:基于内存的集群计算容错抽象

更多大数据系列文章可以参见 GitHub 开源项目大数据入门指南

https://www.cnblogs.com/heibaiying/p/11322704.html

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