本地BLAST

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conda安装:

conda create –name blast

conda activate blast

conda install blast


conda用法:

查看已安装的环境:  conda info -e

conda包管理

# 安装xxxx

conda install xxxx

# 查看当前环境下已安装的包

conda list

# 查看某个指定环境的已安装包

conda list -n python34

# 查找package信息

conda search numpy

# 安装package

conda install -n python34 numpy # 如果不用-n指定环境名称,则被安装在当前活跃环境 也可以通过-c指定通过某个channel安装

conda 更新

# 更新package

conda update -n python34 numpy

# 删除package

conda remove -n python34 numpy

# 更新conda,保持conda最新

conda update conda

# 更新anaconda

conda update anaconda

# 更新python

conda update python

conda 源

# 添加Anaconda的TUNA镜像

conda config –add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/

# TUNA的help中镜像地址加有引号,需要去掉

# 设置搜索时显示通道地址

conda config –set show_channel_urls yes

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